Οι δημοσιογράφοι, Σταύρος Θεοδωράκης, Μαρία Χούκλη, Γκέλυ Βούρβουλη, Κώστας Γιαννακίδης, Τάκης Καμπύλης, Ηλίας Κανέλης και Αντώνης Πανούτσος συμμετείχε στο πρώτο ΔΣ της εταιρείας «Πρόταγκον ΑΕ» η οποία ιδρύθηκε το 2009. Στη διαδρομή αποχώρησαν από το ΔΣ τα περισσότερα από τα πρόσωπα που συμμετείχαν στην ίδρυσης της εταιρείας που διαχειρίζεται το site, www.protagon.gr , το οποίο αποτελεί επί χρόνια τη βάση προβληματισμού για τα δρώμενα στην ελληνική κοινωνία.
Στο τελευταίο ΔΣ του 2013 πρόεδρος της εταιρείας ήταν η Σοφία Βιδάλη, αντιπρόεδρος ο Τάσος Τέλλογλου και μέλος η Βασιλική Αποστολάκη. Ο Σταύρος Θεοδωράκης, ο οποίος είναι μέτοχος της εταιρείας έχει δηλώσει πως θα αποχωρήσει από αυτή, ιδρύοντας το «Ποτάμι». Το 2011 η «Πρόταγκον ΑΕ» εμφάνιζε κέρδη προ φόρων ύψους 75.833 ευρώ, έναντι κερδών προ φόρων, 13.952 ευρώ το 2010 και κύκλο εργασιών ύψους 412.785 ευρώ το 2011, έναντι τζίρου 261.675 ευρώ το 2010. Το 2012 η εταιρεία αύξησε τον κύκλο εργασιών της στα 554.728 ευρώ, ενώ τα προ φόρων κέρδη παρέμειναν στο ίδιο επίπεδο με 72.584 ευρώ.