Προβληματισμό προκαλεί η επιβάρυνση του 2% επί του κύκλου εργασιών υπέρ του ΕΔΟΕΑΠ στο σύνολο των επιχειρήσεων ΜΜΕ. Οι ιδιοκτήτες των ΜΜΕ εμφανίζονται προβληματισμένοι από την επιβάρυνση που έχουν οι εκδοτικές επιχειρήσεις με μεγαλύτερο τζίρο και μεγαλύτερο αριθμό εργαζομένων, καθώς εμφανίζονται να επιδοτούν, με το ποσοστό που αποδίδουν, τις μικρότερες επιχειρήσεις.
Άλλες πηγές επισημαίνουν πως στο ΔΣ του ΕΔΟΕΑΠ εκπροσωπείται μόνο η ΕΙΤΗΣΕΕ και όχι το Δημόσιο, που χρηματοδοτεί, μέσω της ΕΡΤ, τον Οργανισμό, και η συνδρομητική τηλεόραση, με συνέπεια να υπάρχει πρόσβαση στα οικονομικά του.
Υπάρχει η σκέψη της προσφυγής στην Κομισιόν, όμως η κυβέρνηση διαβεβαιώνει πως θα συνεχίσει να πληρώνει μέσω του προϋπολογισμού το κόστος με το οποίο επιβαρύνονται οι επιχειρήσεις ΜΜΕ, καθώς δεν επιθυμεί να ανοίξει μέτωπο με τους δημοσιογράφους.