;Η πρόσβαση των μελών του ΔΣ του ΕΔΟΕΑΠ στους φακέλους των ασφαλισμένων του φορέα προκαλεί προβληματισμό για την προστασία των προσωπικών δεδομένων. Τα μέλη του ΔΣ έχουν τη δυνατότητα να γνωρίζουν το ιατρικό ιστορικό των ασφαλισμένων στον ΕΔΟΕΑΠ και αυτό είναι ένα από τα ζητήματα που θα πρέπει να απαντηθούν στο άμεσο μέλλον από την επόμενη κυβέρνηση. Το ΔΣ ελέγχεται πολιτικά από τη συνεργασία των παρατάξεων ΝΔ – ΣΥΡΙΖΑ.